Pisa, ancor oggi famosa non solo per la sua arte ma anche come sede universitaria (Università del 1343 e Scuola Normale Superiore voluta da Napoleone nel 1813) venne fondata probabilmente dai liguri, divenne poi centro etrusco (sec. IV a.C.), fu occupata dai romani e istituita in colonia (179 a.C.), quindi in municipio (89 a.C.).
Grazie all’attivazione del porto (già attivo in epoca imperiale) svolse il ruolo di rilevante centro commerciale anche nell’alto medioevo, divenendo libera città (sec. X) promotrice di un codice marittimo (Consuetudini di mare, 1075) e quindi libero comune (1081). Attiva durante la 1ª crociata (1096-99), creò una vasta rete di empori e scali nel Tirreno e nel Levante. In urto con Genova per l’egemonia come Repubblica Marinara, decadde per le sconfitte subite (battaglia della Meloria, 1284). Sconvolta dalle lotte fra consorterie nobiliari (sec. XIV) e dalla crisi economica (perdita dei domini sardi, 1326), cadde sotto il dominio dei Visconti (1399-1402) e quindi dei fiorentini. Dopo l’interramento del porto (sec. XVI) si sviluppò come centro culturale (scuola galileiana).

Dal punto di vista storico/religioso Pisa fu importante anche perché vi si svolsero alcuni Concili, sebbene non riconosciuti come Concili Ecumenici. Il primo (1135), fu convocato da Innocenzo II per far fronte allo scisma di Anacleto II. Il secondo (25.3-7.8.1409) fu un tentativo di alcuni cardinali di ricomporre il grande scisma d’occidente: il papa Gregorio XII e il papa avignonese Benedetto XIII furono destituiti e venne eletto Alessandro V; il tentativo fallì poiché i due papi non accettarono la deposizione. Il terzo, detto il “conciliabolo di Pisa”, fu convocato nel 1511 da Luigi XII di Francia nel tentativo di opporsi al papa Giulio II, che rispose convocando il V concilio lateranense (1512). Ebbe scarse adesioni e fu trasferito a Milano, Asti e si chiuse a Lione nel 1512.